Projekt wykonawczy "Rozbudowy i przebudowy oczyszczalni ścieków "Południe" w Nowym Dworze Mazowieckim" opracowany przez Firmę CDM  Sp. z o.o. z siedzibą w Warszawie ul. Stawki 40 zatwierdzony został w marcu 2009 r.
Projekt zakładał zachowanie istniejącego do czasu modernizacji układu mechaniczno-biologicznego oczyszczania ścieków przy unowocześnieniu technicznym i technologicznym procesu oczyszczania.
Ze względu na ogromy stopień wyeksploatowania oczyszczalni konieczna okazała się modernizacja wszystkich obiektów oczyszczalni oraz przepompowni ścieków. Poza modernizacją istniejących obiektów zaprojektowano również nowe jak: wiata separatorów piasku, czy instalacja biofiltru przy budynku pompowni ścieków. Biofiltr miał na celu zneutralizowanie nieprzyjemnych zapachów rozprzestrzeniających się w pobliżu oczyszczalni.
Głównym założeniem modernizacji oczyszczalni  było rozwiązanie problemu gospodarki osadowej.  Mała wydajność odwadniania w stosunku do całkowitej ilości powstającego osadu wymagała, przystosowania jednego z dwóch ciągów technologicznych bloku biologicznego oczyszczalni na tymczasowy zbiornik magazynujący osad nadmierny. W rezultacie obniżyło to przepustowość oczyszczalni o ok. 50 %. W Projekcie założono modernizację stacji odwadniania wraz z instalacją stacji dozowania flokulantu, montaż nowej, dużo wydajniejszej prasy  oraz instalacji wapnowania osadu wraz z silosem do magazynowania wapna co ostatecznie zlikwiduje problem gospodarki osadowej i pozwoli na przyrodnicze wykorzystanie osadu.
Zmodernizowana technologicznie oczyszczalnia wyposażona została w komputerowy system nadzoru wraz z aparaturą kontrolno – pomiarową, umożliwiający monitoring i automatyczne sterowanie procesem oczyszczania ścieków.

Prace modernizacyjne prowadzone były od stycznia 2010 r. przez firmę SKANSKA S.A. z siedzibą w Warszawie ul. Gen. J. Zajączka 9. We wrześniu 2010 r. stopień zaawansowania prac modernizacyjnych wynosił ponad 50%. Do najważniejszych zadań które zostały w tym czasie wykonane należy modernizacja pierwszego ciągu technologicznego bloku biologicznego oczyszczania, który pełnił do tej pory funkcję zbiornika magazynującego osad nadmierny oraz montaż nowej prasy, wraz z instalacją stacji dozowania flokulantu i instalacji wapnowania.

We wrześniu rozpoczęto modernizację drugiego ciągu technologicznego oczyszczania biologicznego, obiekty wchodzące w jego skład były stopniowo opróżniane a urządzenia deinstalowane. Odnawiane były konstrukcje budowlane zbiorników, które następnie wyposażono w nowe urządzenia.

Do maja 2011 r. przeprowadzono szereg prac mających na celu modernizację przepompowni ścieków PS-0, która jest najstarszym obiektem oczyszczalni.
Podczas modernizacji wymieniono m.in. cztery z sześciu pomp ścieków znajdujących się w części suchej pompowni, zainstalowano  nowe kraty schodkowe z prasopłuczką i przenośnikiem odwadniająco- rozdrabniającym skratki. Instalacja nowego przenośnika w znacznym stopniu zwiększyła ich końcowe odwodnienie. W części mokrej zlokalizowana została również automatyczna stacja poboru próbek.
Ponadto w przepompowni odtworzono instalację wentylacyjną, wymieniono instalację elektryczną, ponadto odtworzono konstrukcje i powierzchnie zewnętrzne i wewnętrzne przepompowni. Wykonano również hermetyzację zbiorników czerpnych oraz kanału dopływowego ścieków nieoczyszczonych. Dzięki temu powietrze znad zwierciadła ścieków trafia do biofiltra (w którym jako materiału filtrującego użyto drewna pochodzącego z korzeni), a nie jak wcześniej do otoczenia oczyszczalni.

W czerwcu 2011 r. prace modernizacyjne zostały zakończone. Odbudowane konstrukcje betonowe pomalowano, zagospodarowano obszary zielone na terenie oczyszczalni.  Zainstalowano również aparaturę kontrolno – pomiarową, dzięki czemu możliwy jest monitoring i automatyczne sterowanie procesem oczyszczania ścieków.

Dzięki modernizacji oczyszczalnia ścieków "Południe" w Nowym Dworze Mazowieckim, spełnia najwyższe standardy.

Oczyszczalnia ścieków "Południe" w Nowym Dworze Mazowieckim po modernizacji.

Inwestycja realizowana jest w ramach Projektu „Modernizacja oczyszczalni ścieków wraz z budową sieci kanalizacyjnej i wodociągowej w Nowym Dworze Mazowieckim” dofinansowanego z Funduszu Spójności w ramach Programu Operacyjnego „Infrastruktura i Środowisko” oś priorytetowa I Gospodarka wodno-ściekowa na lata 2007-2013.